1944年，马鹤凌弃笔从戎，去过云南参加滇缅战役，也担任204师的训导员及政工部主任等。后来，马鹤凌由于能力杰出，获得蒋经国的赏识，并且推荐他任职父亲蒋介石的秘书和侍卫官，后来又去小蒋的“救国团”担任中校。